半夜基地外的谢虎等人四处观察地形，寻找基地的突破口，之后众人聚在树林里商量如何潜入基地，就在谈论到一半的时候，突然远处一支袖剑破空而来，径直钉上谢虎身旁的树上。就在众人要追的时候，谢虎告诉众人，来人并无恶意，要不早领日军杀来了，边说谢虎一边抽下扎着一张白纸的袖箭。摊开纸张后，众人都惊讶的合不拢嘴，这张纸上画的分明是基地内外的地形图，上面除了标示每个岗哨地点与守卫人数之外，最重要的是反应堆的位置。马守仁看完这张地图后，异常兴奋，马守仁告诉众人，日军为求隐密与安全考量，将反应堆建造在三百公尺的地底下，而这个看似保险安全的作法，实际上却是给了众人破坏的大好机会，只要炸毁反应堆后将地道封死，那么辐射就难以泄露出来，就不会危害附近百姓。谢虎等人听完立即为之一振，开始仔细的研究地图找寻攻破基地的机会。
基地边上的厨房中，胜秣边动手包着次郎爱吃的饭团，边用衣袖擦干眼泪，想到弟弟多年所受的苦，而今天是次郎的生日，次郎逃出来之后的第一个生日希望收到的礼物竟然是吃胜秣包的饭团，于是胜秣亲手给弟弟来做饭团。
次郎从基地内的军火库走了出来，背着一包炸药，小心翼翼的进入地下基地，杀死守卫后开始在反应堆周围安装炸药，没想到板垣不知从哪冒了出来，次郎顿时大惊，忙从手中拿出火柴，点着引线，坂垣拔出军刀，冲向次郎。
次郎点燃引线互助身后的炸药，想挡住坂垣，可次郎岂是坂垣的对手，不出几招就被坂垣逼到墙角，接着坂垣一刀就将炸药的引线砍断，胜秣再也无法点燃引线，次郎见不可能再点爆炸药，情急之下打开标记有"辐射危险"的房间门，关上房门，将自己完全暴露在高度辐射之下。
胜秣在厨房里为弟弟做好饭团，送到次郎房间，在次郎桌上发现一封信，胜秣忙打开信读了起来。这是次郎的诀别信，次郎要胜秣立即离开基地，因为他即将要引爆地下基地的反应堆，让制造原子弹的设备永远埋在地底之下。胜秣急忙往地下基地冲去，一冲进基地后看到的是板垣正交代防化人员打开反应堆的门，抬出次郎。被抬出来的次郎因为暴露在重度核辐射之下，已经被严重感染，变得奄奄一息了。板垣原本气愤的心情在看到徒弟次郎的样子之后，叹息一声就离开了，留下胜秣在守护次郎。
奄奄一息次郎向胜秣说出了他的真实遭遇，在亲身南京大屠杀和武汉会战之后，次郎对中日双方军民的大量伤亡深感痛心，在回国休假期间加入了日本的反战同盟。回到中国后，他逃离了军队，游走在各地进行反战的活动。直到最近反战同盟将日军研制原子弹的情报传递给他，于是次郎决定利用胜秣弟弟的身分混入基地，趁机破坏这足以让全人类毁灭的武器。次郎强撑着劝告胜秣，让她立即离开基地，再也不要为这场罪恶的战争充当帮凶，胜秣看着全身开始溃烂的次郎难过的说不出话来。
终极任务第32集剧情介绍谢虎和众突击队员看着地图研究潜入基地的办法，看来看去，要想潜入难度极大，如果被发现，大家都有可能献出生命。马守仁告诉谢虎，如果不毁掉这个基地，一旦日本人造出原子弹，别说是中国要亡国，连世界都可能毁灭。众人沉默了一会，谢虎告诉众人，要炸毁基地就要抱着必死的决心，他不强求大家，如果不愿进入基地的同志可以在外面做接应。大家举手报名，林无剑第一个举手，宋无娇也举起了手，紧接着童赫娴和沐荀菲也举手，小刀看看众人，也将手举了起来。队员们如此同心协力，另谢虎深感欣慰。谢虎命令童赫娴和游击队在外接应，自己则带领队员们都在身上绑好炸药，直奔基地方向而去。
众人来到基地墙外，宋无娇化妆成日军往正门而去，沐荀菲则在不远处准备偷袭。同时小刀攀爬围墙扑向探照灯旁边的守卫。从山顶飞下来的谢虎与林无剑，则分别在不同的建筑物楼顶着陆。巡逻的哨兵发现探照灯不动，忙靠近探查，有士兵发现了小刀的身影，一时间枪声大作惊动了所有人。
次郎听到了外面的枪声，知道是游击队攻进来了，次郎露出微笑，紧紧的抓住胜秣的手，用最后的力气告诉胜秣，原子弹这种武器绝对不能被日本军队掌握，否则人类将面临灭亡，基地一定要毁灭掉。说完之后次郎双眼紧瞪着胜秣，咽下了最后一口气。
童赫娴率领着游击队在基地外接应，听到基地内枪声大作，知道谢虎等人已经攻了进去，大喊一声带领游击队冲向基地，游击队支援而来的各种山炮也开始对基地内发炮，基地内的日军也不甘示弱，双方激烈的交火。
冲进基地内的宋无娇与沐荀菲遇上鸠山，将其活捉作为人质，让围攻二人的日军有所顾忌，两人慢慢往基地核心靠近。另一面的谢虎与林无剑正跟板垣交手，你来我往大打出手，一时间内难分胜负。小刀是最先被日军发现的，却也是最先跑到基地中心门口的，只是主楼大门紧闭，周围武士众多，小刀一时间没有好办法，只能在门口与武士纠缠，等待其他人靠拢协助。此时中村持枪从旁边缓缓靠近小刀，趁其不注意时连开数枪打中小刀，受重伤的小刀眼见难逃一死，用尽最后的力量扑倒在主楼前引爆了炸药，连同中村在内的多名日军与小刀同归于尽。
