董剑飞被捕，萧船、罗长发被冯阳和魏大勇击昏抓了起来。
中村功交待端木星监听关在一间牢房里的莫翻译官和董剑飞。董剑飞和莫翻译官在牢房里聊些不着边际的话题。
中村跟藤田汇报自己没有时间审讯董剑飞，藤田决定由云子负责。藤田告知中村功军部怀疑他不是日本人，中村功不以为然。实际上感到了很大压力。
藤田安排小林监视中村功。
云子决定严刑审讯董剑飞，以便试探杜鹃。
罗长发和萧船被关在了重光堂的地下室。云子吩咐魏大勇把萧船和罗长发关在黑暗中48小时逼供，希望获得谁是杜鹃的秘密。
中村功放了莫翻译官。
新四军指挥部收到四号线汇报，猫爪牺牲，董剑飞被捕。
董剑飞被晴气严刑审讯。
智者无敌分集剧情介绍 第二十集中村功得知了萧船等被抓的消息。
地下室，萧船和罗长发互相试探。
正在此时，西里龙夫被调回东京。而中村功在读卖新闻上发现了武田留下的讯息，决定赶回东京获取情报。
重光堂地下室，罗长发和萧船互相鼓励活下去。
中村功为了刺探情报，跟云子说自己要辞职回东京。
营左也发现了读卖新闻上的密码。
藤田安排中村功回东京跟军部申诉。并命他审讯董剑飞。
中村功临行前命端木星枪决董剑飞。
智者无敌分集剧情介绍 第二十一集狱中的董剑飞收到了“正在营救你”的纸条。
莫翻译官分别跟藤田和中村功汇报，董剑飞还掌握重大秘密，不能杀。
刑场上，董剑飞就要被枪决，枪声已响，藤田和云子赶到大声阻止，才发现董剑飞根本毫发无损。这只不过是中村功的试探。
藤田拿到了别人送给董剑飞的纸条。
藤田想发电报给东京让军部扣留中村功，云子说服他再给中村功一次机会。
中村功出发去东京，临走前给端木星布置了几件任务。
日本，武田被营左追捕，绝境之下自裁于悬崖边。
这时云子躲过了一次暗杀。
江南指挥部接到了四号线的汇报，他们指示四号线切断跟董剑飞的联系。
武田的尸体被军部发现了，营左发现了尸体上的刺青，他认为那是一组密码。营左命人割下了那块皮肤，决定让中村功来破解密码。
智者无敌分集剧情介绍 第二十二集营左把中村功带到了情报局审讯室，武田的情人良子正在那里受刑。营左表示如果中村功愿意破解密码，他就放了良子。
中村功要求给他一天时间，他将破解出报纸上的密码，实际上营左已经破解了密码，他在诱敌深入。中村功还告诉营左，武田身上的刺青是明智武士的符号，他需要一天时间破解出刺青上的密码。
中村功按照报纸上的密码找到了南门町，在那里遇到了残废军人小林泽，并让小林泽到二楼去找武田，小林泽奉命行事，结果被警察抓住带走。
中村功趁乱上了二楼，打晕了留守的警察，然后他见到了武田的尸体，这时墙上的浮世绘引起了他的注意。
营左带人返回来围捕中村功，危机时刻，中村功被良子所救。两人逃脱，中村功根据画里的指示决定去帝国大学继续寻找线索。两人伪装成教授和助理进入图书馆查找资料。
在图书馆，中村功给良子解释了武田留下的线索。他根据源氏物语的不同版本，发现了“云峰的温泉”这句话就是武田留下的线索。
这时营左也发现了画里的意思，他带领警察追赶到了图书馆，最后一刻，中村功和良子逃了出来。中村功给西里龙夫打电话，让他帮忙想想云峰的温泉是什么意思。
中村功和良子分头行动以迷惑营左，中村功赶到新宿饭店与西里龙夫会面。
